توالی اسید نوکلئیک

توالی نوکلئیک اسید به ترتیب و آرایش جای گرفتن نوکلئوتیدها در دی ان آ یا آران آ گفته می شود. این توالی را از چپ به راست، از پایانهٔ '۵ به پایانهٔ '۳، با حرفهای اختصاری نوکلئوتیدها نشان می دهند.
A: آدنین
C: سیتوزین
G:گوانین
T: تایمین
R: باز G یا A
Y: باز T یا C
K: باز T یا G
M: باز A یا C
S: باز G یا C
W: باز A یا T
B: باز G, C, T
D: باز G, T, A
H: باز T, C, A
V: باز G, C, A
N: هر یک از چهار باز A, C, G, T
نوکلئیک اسیدها زنجیره ای از واحدهایی به نام نوکلئوتیدها هستند. هر نوکلئوتید از سه زیر بخش تشکیل شده است: یک گروه فسفات، یک گروه قند که ستون رشته ها را می سازد و یک باز نوکلئوتیدی که به ستون متصل می شود. بازهای نوکلئوتیدی با یکدیگر تشکیل پیوندهای شیمیایی می دهند که در نهایت منجر به تشکیل ساختاری مرتبه بالاتر دوم و سوم می شوند. نمادهای مورد استفاده A, C, G, T هستند که به ترتیب نشان دهندهٔ بازهای آدنین، سیتوزین، گوانین و تایمین هستند. توالی نوکلئوتیدها را با قرار دادن این نمادها پشت یکدیگر (برای مثال به صورت AAACCGGT) نشان می دهند. هر توالی دارای یک رشته مکمل است که نشان دهندهٔ رشته ای است که در مقابل آن به صورت معکوس قرار می گیرد.
علاوه بر چهار نماد گفته شده، از نمادهای دیگری نیز برای نشان دادن ابهام هنگامی که بیش از یک باز در یک مکان می تواند قرار گیرد نیز استفاده می شود. این نمادها توسط آیوپاک به صورت زیر استاندارد شده است:
این نمادگذاری برای آران آ نیز برقرار است با این تفاوت که به جای T (تایمین) باز U (یوراسیل) استفاده می شود.