رسم نقطه ای

رسم نقطه ای(به انگلیسی: Dot Plot) یک روش گرافیکی برای مقایسه دو دنبالهٔ بیولوژیکی، به هدف پیدا کردن مناطقی که در آنها بیشترین شباهت بین دو دنباله وجود دارد میباشد.
http://www.scribd.com/doc/17727/complete-notes-on-Bioinformatics
ساده ترین راه برای درک شباهت بین دو دنباله پروتئینی استفاده از نوعی ماتریس شباهت است که به آن رسم نقطه ای می گوییم. رسم نقطه ای یک ماتریس دو بعدی است که دو دنباله پروتئینی محورهای افقی و عمودی آن را تشکیل داده و با هم مقایسه می شوند و در دهه ۱۹۷۰ توسط فیلیپس معرفی شد.
یک راه ساده برای نمایش شباهت بین دو دنباله این است که در صورت یکسان بودن عنصری از محور افقی با عنصر دیگری از محور عمودی، درایه های متناظر با آن را در ماتریس، نقطه بگذاریم.در نتیجه بخش های منطبق در دنباله به صورت خط های مورب در ماتریس ظاهر میشوند.
بر اساس تعداد و طول بخش های منطبق (خط های مورب در ماتریس) میتوان شباهت دو دنباله را نتیجه گرفت.در ماتریس دو پروتئین عیناً مساوی قطر اصلی ماتریس توسط نقطه ها پر میشود و هرگونه حذف و اضافه در عناصر دنباله ها باعث اختلال در قطر اصلی می گردد. علاوه بر قطر اصلی ممکن است قطرهای دیگری در ماتریس توسط نقطه ها ایجاد شود که نشان دهندهٔ شباهت های محلی یا بخش های تکراری در دنباله است.به دلیل محدود بودن الفبای پروتئین ها بسیاری از بخش های منطبق ممکن است اتفاقی رخ داده باشند. یک راه برای کاهش انطباق های اتفاقی این است که فقط قطرهای چندتایی را در ماتریس نگاه داشته، باقی را حذف کنیم (مثلاً قطرهای سه تایی).این کار مؤثر است چون احتمال اتفاقی بودن انطباق سه عنصر پشت سر هم در دنباله، بسیار کمتر از انطباق یک عنصر است.