شبکه فیلوژنتیک

شبکه فیلوژنتیک گرافی است که جهت نشان دادن ارتباط تکاملی (به صورت صریح یا غیر صریح) بین دنباله نوکلئوتیدها، ژن ها، کروموزوم ها، ژنوم ها، یا گونه ها استفاده می شود. شبکه فیلوژنتیک وقتی مورد استفاده قرار می گیرد که شبکه ای از وقایع مانند انتقال عمومی ژن، جفت گیری، تکثیر ژن و انقراض مورد بحث باشد. شبکه فیلوژنتیک یک مدل شدن کاملاً متفاوت با درخت فیلوژنتیک هستند. به این معنی که ندهای هیبرید(ند با دو والد)به جای ندهای درختی (ند با یک والد) اضافه شده اند. درخت های فیلوژنتیک یک زیر مجموعه از شبکه های فیلوژنتیک هستند. شبکه های فیلوژنتیک را می توان با نرم افزارهایی مانند SplitsTree به تصویر کشید. شکل استاندارد برای نمایش شبکه های فیلوژنتیک استفاده از مدل Newick format است، که شبکه ها را به خوبی درختان پشتیبانی می کند.
گراف میانه
شاخه بندی
سامانه شناسی
بیوانفورماتیک
فیلوژنتیک محاسباتی
فیلوژنتیک مولکولی
رویان شناسی
بافت شناسی
درخت فیلوژنتیک
میکرو بایولوژی
ریخت شناسی
چندین نوع و زیر مجموعه از شبکه های فیلوژنتیک بر پایه پدیده های زیستی نمایش داده می شوند، یا تاریخ آن ها ساخته می شود(مثلاً شبکه های هیبریدی معمولاً با استفاده از ریشه درخت ریشه دار ساخته می شوند، شبکه های جفت گیری از روی دنباله باینری، شبکه های میانه از روی یک مجکوعه از splitهاو...)
با استفاده ار درختان فیلوژنتیک نمی توان پدیده های مربوط به microevolution را نشان داد. برای مثال توزیع جغرافیایی جمعیت موش ابی یا ماهی از یک گونه خاص در میان شبکه رودخانه ها، زیرا یک گونه مرزی وجود ندارد که از انتقال ژن جلوگیری کند.برای دیدن شبکه های فیلوژنتیک عمومی و کاربرد آنها، این مرجع را مشاهده کنید.
دو نوع شبکه فیلوژنتیکی وجود دارد